La chapelle Sainte-Germaine est un édifice de style néo-gothique construit entre 1869 et 1871, à l'initiative de Monseigneur Donnet, Archevêque de Bordeaux (1795-1882), sur un terrain offert par Gustave Gounouilhou. Les vitraux sont réalisés en 1899 par Isidore Pomès, maître-verrier bordelais. Dans la seconde moitié du XXe siècle, la restauration de l'intérieur de la chapelle est confiée à la congrégation du Bon Pasteur. 

Le 3 juillet 2016, la chapelle est offerte, sous forme de don, à la communauté orthodoxe russe de Bordeaux par le diocèse catholique de Bordeaux.